Primer Tutorial de Diseño

cebadores son piezas cortas de ADN utilizado en una técnica biológica conocida como la reacción en cadena de la polimerasa ( PCR). PCR es utilizado por los biólogos moleculares para amplificar secuencias de genes para el análisis científico más sofisticados , tales como la secuenciación de ADN , la clonación o varias aplicaciones biotecnológicas. Primer diseño es una habilidad que debe ser dominado por cualquier persona que desee estudiar los genes , y requiere una sólida comprensión de la biología y la genética . Aunque las reglas para el diseño del cebador son relativamente sencillas , las complejidades de la genética , plataformas experimentales y sistemas de computación han dado lugar a cientos de programas de software avanzadas que se pueden utilizar para el diseño del cebador. Instrucciones
Primer Tutorial de Diseño Matemáticas 1

Obtenga su identidad genética para la base de datos Entrez Gene . Búsqueda de la identidad " REFSEQ " de su gen con sólo introducir el nombre de su gen en el cuadro de búsqueda . Obtener la identidad cDNA Refseq de su gen elegido ( por ejemplo, " NM_136342 " ) .
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Descargue la secuencia " FASTA " . Este es el contenido de nucleótidos de su gen representado como alfabetos y es básicamente un archivo de texto . Busque el "mayor que" símbolo ( > ), que señala el comienzo de la secuencia del gen . O seleccione , copie y pegue la secuencia completa o haga clic en el botón " Descargar" para recuperar a su computadora .
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Obtener su secuencia genética . Ir a la página web de Blat o BLAST ( genome.ucsc.edu/cgi - bin/hgBlat ) y pegue la secuencia FASTA - formato en el cuadro de búsqueda . Haga clic en " Enviar".
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Utilice una herramienta de diseño de la cartilla profesional. Estos incluyen software como el PerlPrimer libre disposición , o los más sofisticados , pero comerciales como VectorNTI y MacVector . En PerlPrimer ( perlprimer.sourceforge.net/) , sólo tiene que subir su secuencia en el software y haga clic en "Find cebadores . "
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Comprobar los cebadores . Usted debe ver hacia delante y atrás primers ( " primer pares ") , con posiciones numéricas en la secuencia , longitudes de cebadores , temperatura de fusión y primer secuencia completa . Compruebe que las parejas de cebadores todas las reglas de diseño de la cartilla , como la formación de dímeros de primer débil , la presencia de una abrazadera GC en los tres prime -end ( 3 ' ) de la cartilla , y que al menos un cebador se encuentra que abarca una frontera intrón - exón .
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Verifique los productos generados por los cebadores . Ejecutar una PCR electrónica (por ejemplo , ePCR de NCBI ) para comprobar los tipos o propiedades de los productos de genes producidos por los cebadores en una reacción de PCR simulada .